Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
CENPEQ02224 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPEQ02224 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.2 ms