Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PTPRTO14522 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PTPRTO14522 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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PTPRTO14522 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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PTPRTO14522 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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PTPRTO14522 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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