Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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