Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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