Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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GRIK3Q13003 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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GRIK3Q13003 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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GRIK3Q13003 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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GRIK3Q13003 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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