Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms