Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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