Protein–RNA interactions for Protein: Q15742

NAB2, NGFI-A-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB2Q15742 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAB2Q15742 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NAB2Q15742 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms