Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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