Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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NRF1Q16656 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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NRF1Q16656 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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NRF1Q16656 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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NRF1Q16656 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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NRF1Q16656 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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NRF1Q16656 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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NRF1Q16656 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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