Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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