Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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