Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gadd45gip1Q9CR59 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms