Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 771.5 ms