Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TK1P04183 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TK1P04183 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TK1P04183 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TK1P04183 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TK1P04183 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TK1P04183 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TK1P04183 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TK1P04183 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TK1P04183 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms