Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SQSTM1Q13501 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SQSTM1Q13501 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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