Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNN3Q15417 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNN3Q15417 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNN3Q15417 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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