Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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