Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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