Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
EIF4EBP1Q13541 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.2 ms