Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL9A2Q14055 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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