Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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DDX39BQ13838 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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DDX39BQ13838 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX39BQ13838 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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DDX39BQ13838 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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