Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL3L1P16619 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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CCL3L1P16619 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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