Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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