Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRTO14522 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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