Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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