Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms