Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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SQSTM1Q13501 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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