Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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