Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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