Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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