Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CNN3Q15417 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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