Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
COL9A2Q14055 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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COL9A2Q14055 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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COL9A2Q14055 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
COL9A2Q14055 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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