Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms