Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CNN3Q15417 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNN3Q15417 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNN3Q15417 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNN3Q15417 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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CNN3Q15417 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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CNN3Q15417 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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