Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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