Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPN13Q12923 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.2 ms