Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PnckQ9QYK9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PnckQ9QYK9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms