Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EXT1Q16394 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms