Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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