Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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