Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRTO14522 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRTO14522 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRTO14522 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRTO14522 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRTO14522 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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