Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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PTPRTO14522 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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