Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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