Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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PTPRTO14522 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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PTPRTO14522 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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PTPRTO14522 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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PTPRTO14522 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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