Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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