Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms