Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RDH8Q9NYR8 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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RDH8Q9NYR8 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RDH8Q9NYR8 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RDH8Q9NYR8 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RDH8Q9NYR8 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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