Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RDH8Q9NYR8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms