Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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